单基因遗传病研究
研究背景
根据原卫生部发布的《中国出生缺陷防控报告(2012)》数据显示,我国出生缺陷总发生率约为5.6%。按照每年1600万的新生儿计算,每年将新增90万的新生缺陷儿。在各种导致出生缺陷的原因中,单基因遗传病约占22.2%[1]。
有研究显示,84%的人携带至少1个致病变异[2],变异基因既可来自于父母,也可源于自身,都有可能遗传给下一代。携带者夫妻往往没有任何症状,但却有生育隐性遗传病患儿的风险。在常规产检中,隐性遗传病患儿通常无法检查出异常,直到出生后出现病症才得以发现。这类疾病多数致死、致畸、致残,且其中95%都缺乏有效的治疗方案[3]。因此,预防此类出生缺陷的首次发生是最经济最有效的防控策略。
传统的携带者筛查只针对特定地域/种族的单一疾病进行致病基因的携带者筛查,随着高通量测序技术的发展和成本降低,携带者筛查已经由单病种扩展至多种疾病筛查[4-6]。这种扩展性携带者筛查效率更高、成本更低,并能最大程度的检出风险夫妇。
本研究旨在通过对遗传病致病基因进行检测,从表型正常的育龄人群中发现致病突变的携带者,分析确定夫妇双方是否为同一单基因常染色体隐性或X连锁隐性遗传的致病基因携带者,预判生育遗传患儿的潜在风险。结合遗传咨询、产前诊断、辅助生殖等措施有效避免严重缺陷患儿的出生,为每一对育龄夫妇生育健康的宝宝提供一份保障。
研究方法
遵循国际指南要求,根据ACMG发布的《隐性遗传病携带者筛查指南》(2021年)及国家卫健委发布的《罕见病诊疗指南(2019版)》覆盖的遗传疾病,结合亚洲及中国人群携带率进行调整,精选中国人群相对高发遗传病。
运用靶向捕获结合高通量测序技术,采用个性化的定制探针,检测目标基因的胚系变异,根据NGS检测行业标准,确保平均测序深度>200X,Q30>85%,30X覆盖度占比>99%,另外根据独有的数据分析方法,保证检测的胚系变异准确性在99%以上。
研究成果
目前,该研究成果已成功转产——单基因遗传病188项基因检测。覆盖了ACMG《隐性遗传病携带者筛查指南》中94% * 的疾病和国家卫健委《罕见病诊疗指南(2019版)》中90%* 以上的单基因隐性遗传病常见亚型,再结合亚洲及中国人群携带率较高的遗传疾病,可一次性筛查188 种亚洲人群特别是中国人群中相对高发的严重单基因遗传病,主要包括常染色体隐性和X 连锁隐性遗传病,涉及遗传代谢病、神经肌肉病、视力听力障碍、免疫感染、内分泌等多个系统的单基因遗传病,覆盖170 个基因。总体来说,约58% 疾病提示有相关可治疗药物( 其中约40% 已获批上市)。
* 注:部分单基因隐性遗传病存在多个致病基因的情况,本产品对其检测患病群体占比较大的致病基因或发病率较高的疾病类型。
参考文献:
[1]《中国出生缺陷防治报告(2012)》
[2]Martin, Julio, Asan, et al. Comprehensive carrier genetic test using next-generation deoxyribonucleic acid sequencing in infertile couples wishing to conceive through assisted reproductive technology[ J]. Fertility and Sterility:ORPHAN DRUG REPORT 2014
[3]Bell CJ, et al. Carrier testing for severe childhood recessive diseases by next-generation sequencing. Sci Transl Med. 2011 Jan 12;3(65):65ra4.
[4]Julio Martin, et al. Comprehensive carrier genetic test using next-generation deoxyribonucleic acid sequencing in infertile couples wishing to conceive through assisted reproductive technology. Fertility and Sterility 2015 Nov, 104(5):1286-93.
[5]Imran S. Haque, et al. Modeled Fetal Risk of Genetic Diseases Identified by Expanded Carrier Screening. JAMA. 2016;316(7):734-742.
[6]Gregg AR, et al. Screening for autosomal recessive and X-linked conditions during pregnancy and preconception: a practice resource of the American College of Medical Genetics and Genomics (ACMG). Genet Med. 2021 Oct;23(10):1793-1806.