BRCA1/2基因胚系突变研究

研究背景

BRCA1和BRCA2是最早发现的直接与遗传性乳腺癌有关的两个基因。作为抑癌基因，两者在调节细胞复制、DNA损伤修复、细胞的正常生长方面起着重要作用。随着研究的深入，BRCA1/2基因被发现与前列腺癌、卵巢癌、胰腺癌、结直肠癌等多种癌症相关。

对于BRCA1/2基因全外显子突变的检测，在分析方法上存在明显差异。包括检测大片段重排的技术，最低读取深度的标准，是否测序非编码区域，变异分类的标准和方法。另外研究显示黄种人BRCA1/2的突变情况跟现有的公共数据库存在差异，建立中国人自身的突变数据库的就显得尤为必要。因此，我们迫切需要一种准确的检测分析方法和中国人群匹配的数据库，来分析突变携带者的疾病风险。

基于此，本研究进行了大规模人群BRCA1/2基因的胚系突变检测，建立了中国汉族人群的BRCA基因变异数据库。

研究方法

通过构建扩增BRCA1/2基因全部外显子序列以及外显子内含子拼接区的多重PCR技术，并通过二代测序技术对多重PCR后建立的BRCA1/2基因文库进行测序，为进一步检测癌变基因提供依据。

采用PCR扩增富集靶标片段，能够有效避免全基因组测序造成浪费现象的发生，同时此检测方法具有检测成本低、非介入性、方便快捷，极大降低患者痛苦和负担的特性。

通过使用fluidigm阵列芯片，能够同时进行192份不同样品的BRCA1和BRCA2全外显子扩增，达到缩短实验时间及节省样品的目的，且还可以大大简化上游测序样本的制备和更好地利用第二代测序技术。

研究成果

第一阶段

2018年，南方基因与爱康国宾、澳门大学等机构合作在英国顶级医学期刊《英国医学杂志》（BMJ）发表了《中国汉族人群BRCA1/BRCA2致病变异的流行情况》。

第二阶段

2018年9月-2021年8月，与爱康国宾合作，对238,627位中国汉族人群进行了BRCA遗传基因检测，其中有1,295位的BRCA基因存在致病变异，发生率为0.54%。即每185名中国汉族个体中有1名BRCA致病变异携带者，在约13亿中国汉族人口中约有703万BRCA致病变异携带者。

182,566位同时做BRCA基因检测和乳腺彩超的人群中，检测到975位BRCA致病变异，其中有341位乳腺彩超检查结果显示有乳腺结节，乳腺结节检出率为34.97%，高于爱康总体乳腺结节的平均检出率25.68%。

13,821位同时接受了糖类抗原15-3检测。携带BRCA致病变异的成都地区体检客户中糖类抗原15-3增高的检出率为3.95%(3/76)，未携带BRCA致病变异的成都地区体检客户糖类抗原15-3增高的检出率为0.96% (132/13,745)。

基于两阶段的研究数据，绘制了中国BRCA阳性率分布图，建立了大规模的中国人群BRCA基因突变数据库。